參加新型農村合作醫(yī)療的農民因病住院治療，可獲得住院期間包括藥費、床位費、診查費、護理費、治療費、手術費、輸液費、輸血費、輸氧費、常規(guī)影像檢查以及常規(guī)化驗(血、尿、大便常規(guī))費用的補償。
住院醫(yī)療費補償設立起付線和封頂線，起付線標準為：鎮(zhèn)級定點醫(yī)療機構80元，市中醫(yī)院100元，市婦幼保健院150元，市一醫(yī)院、市二醫(yī)院、市三醫(yī)院、泰康醫(yī)院、南城衛(wèi)生院城區(qū)部、開發(fā)區(qū)衛(wèi)生院、衛(wèi)校附院、愛普眼科醫(yī)院200元，市外定點醫(yī)療機構500元。
封頂線為50000元，即新型農村合作醫(yī)療基金為每個人在1年內住院醫(yī)療費累計補償總額不超過50000元。
參加新型農村合作醫(yī)療的農民每次住院的醫(yī)療費用在起付線以下時由個人負擔，超過起付線后的醫(yī)療費用從新型農村合作醫(yī)療住院基金中按比例補償：
(一)在鎮(zhèn)級定點醫(yī)療機構住院治療，醫(yī)療費用在80元以上的部分補償80%;
(二)在市中醫(yī)院住院治療，醫(yī)療費用在100元以上的部分補償70%;
(三)在市婦幼保健院住院治療，醫(yī)療費用在150元以上的部分補償65%;
(四)在市一醫(yī)院、市二醫(yī)院、市三醫(yī)院、泰康醫(yī)院、南城衛(wèi)生院城區(qū)部、開發(fā)區(qū)衛(wèi)生院、衛(wèi)校附院、愛普眼科醫(yī)院住院治療，醫(yī)療費用在200元以上的部分補償60%;
(五)在市外醫(yī)療機構住院治療，醫(yī)療費用在501元至至5000元(含5000元)部分補償40%;5000元以上的部分補償45%。
參加新型農村合作醫(yī)療的孕產婦住院分娩每人補償350元。
參合農民因危、急、重癥等情況在門診實施緊急搶救后住院的，其門診緊急搶救費并入住院費用中報銷;參合農民在一年內患同一種疾病連續(xù)轉院治療的，只計算其中最高級別醫(yī)院的一次起付線;農村五保戶、低保戶、特困優(yōu)撫對象取消住院起付線標準。
新型農村合作醫(yī)療補償辦法：
(一)參加新型農村合作醫(yī)療的農民在定點村衛(wèi)生室、衛(wèi)生院門診就診發(fā)生的醫(yī)療費用，由醫(yī)療服務機構直接從合作醫(yī)療證門診家庭帳戶中扣減;在市級定點醫(yī)療機構門診就診的，由就醫(yī)者持門診醫(yī)療費用發(fā)票回戶口所在地定點村衛(wèi)生室辦理補償手續(xù)。
(二)參加新型農村合作醫(yī)療的農民在市內定點醫(yī)療機構住院發(fā)生的醫(yī)療費用，由醫(yī)療服務機構在就醫(yī)者出院結算時即時補償，補償部分的費用由醫(yī)療服務機構先行墊付，就醫(yī)者出院時只需繳納補償后自費部分的費用。
(三)環(huán)城、北城、開發(fā)區(qū)轄區(qū)內參合農民在當地衛(wèi)生院住院的，其報銷政策執(zhí)行鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院有關報銷政策和規(guī)定。
(四)經市合管辦批準轉
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