福建中醫(yī)學院創(chuàng)建于1958年，是我國創(chuàng)辦最早的高等中醫(yī)藥院校之一，是福建省中醫(yī)藥教學、科研、醫(yī)療中心和我國對外對臺中醫(yī)藥合作交流基地和福建省重點建設高校。學校設有9個系(部)、3個二級學院，8所附屬醫(yī)院，25個本科專業(yè)及方向；現(xiàn)有2個博士學位授權點、3個一級學科碩士學位授權點、18個碩士學位授權點、8個省局級重點學科、9個國家中醫(yī)藥

管理局重點專病專科，其中碩士授權點涵蓋了所有中醫(yī)學科，本科專業(yè)涵蓋了醫(yī)、理、工、管四大學科門類。全校現(xiàn)有各類在校學生近萬人。
福建中醫(yī)學院師資力量雄厚，辦學成果豐碩。全校現(xiàn)有教職醫(yī)護員工2400余人，有博士、碩士生導師300多名。一大批德高望重的學術、學科帶頭人擔任國家級名老中醫(yī)學術繼承人指導老師，獲得國家有突出貢獻的中青年專家、福建省優(yōu)秀專家等稱號或享受國務院特殊津貼。學校擁有中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)骨傷科學、中西醫(yī)結合等一批國家、省級重點學科和一批國家、省級重點實驗室、醫(yī)療中心、臨床藥理基地等，在中醫(yī)經絡研究、中醫(yī)骨傷科學基礎研究、中西醫(yī)結合老年病研究、中醫(yī)證的研究、白內障基礎與臨床研究、中草藥規(guī)范化種植與開發(fā)利用、中醫(yī)藥信息研究等方面在全國居于領先地位。2002年和2007年，學校在教育部組織的兩輪本科教學工作水平評估中，均被評為“優(yōu)秀”。
福建中醫(yī)學院還是一所外向型的中醫(yī)藥大學。學校從1988年起招收臺灣學生，是全國第一個招收臺灣學生的中醫(yī)藥院校。目前，學校是實行對臺灣單獨招生的高校之一，在校的臺港澳學生及外國留學生有400多名，對臺教育與交流成為辦學特色。學校還與美、德、奧、日、韓、新、馬、泰等二十幾個國家和臺港澳等地區(qū)建立了密切合作關系。
福建中醫(yī)學院環(huán)境優(yōu)美，辦學條件優(yōu)越。學校擁有旗山、屏山兩個校區(qū)，共占地1096畝，各類建筑面積27萬平方米，其中旗山校區(qū)是學校辦學主體所在地，校內教學、科研設施先進，生活設施齊全。校圖書館是福建省中醫(yī)藥圖書文獻信息中心。學校注