1、兩者的學費不同：
民辦本科高校的學費是公辦本科高校的三到四倍。
公辦本科高校的費用相對民辦而言是比較少的。
2、兩者的創辦者不同：
民辦本科高校由民辦企業事業組織、社會團體及其他社會組織和公民個人創辦。
公辦本科高校由國家政府部門創辦。
3、兩者的資金和經費來源不同：
民辦本科高校的資金和經費來自私人經費，屬于非國家財政性教育經費。
公辦本科高校的資金和經費基本全部來源于政府財政撥款。
大多數民辦學校的資源沒有公辦的好，比如教師水平，圖書館藏書量等。而且民辦高校需要自己出錢，學費稍微高一點。還有就是等你畢業后找工作稍微比公辦學校的困難一點，因為民辦高校在中國的口碑不算很好。很多公司都不認你的學歷，考公務員的時候要更難一點，但不可否認的是某些民辦的高校會比公辦三本和大專好一些也有可能。
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