山西中醫學院是一所年輕的高等中醫藥院校。學校于1982年由國務院批準籌建。1986年學校接收原山西醫學院中醫大學班，1989年6月正式掛牌成立，同年開始接受本科生。1999年6月，學校通過了國家教育部組織的本科教學工作合格評估。2002年開始招收留學生。2004年，學校接收了原太原鐵路中心醫院和太原鐵路結核病醫院，并改建為山西中醫學院中西醫結合醫院。2007年4月,學校以“良好”的成績通過了教育部本科教學工作水平評估。2008年2月，學校獲得了碩士單位

授予權，2017年開始招收碩士研究生。學校現已成為山西省中醫藥教育、科研、醫療的中心。

建校以來，學校的辦學實力不斷積累壯大，機構設置日趨合理。學校占地面積174698.46m2，建筑面積137996.40m2。現有固定資產總值1.78億元，其中教學科研儀器設備總值3656萬元。圖書館建筑面積為16200m2，館藏紙質圖書43萬冊、電子圖書近32萬冊，是山西省中醫藥信息中心、山西省高等院校圖書館自動化建設乙級館。校本部設有中醫系、針灸推拿系、中藥系、護理系、中西醫結合臨床醫學系、基礎部、社科部、體育部、計算機教學與網絡管理中心、國際教育中心、實驗管理中心、成人教育學院等教學單位，有60個教研室，17個教學實驗室，4個科研實驗室，1個科研實驗中心。另有一所辦學體制相對獨立的專科層次二級學院山西中醫學院推拿職業技術學院。

學校以中醫藥專業為主體，專業建設與學科建設同步發展。現設有中醫學、針灸推拿學、中藥學、中西醫臨床醫學、護理學5個專業和中醫學醫學英語、中醫學醫藥信息管理、針灸推拿學英語、中藥學中藥分析4個專業方向。其中，中醫學專業為國家級第一類特色專業建設點，中醫學、針灸推拿學、中藥學3個專業為省級品牌專業；中醫臨床基儲針灸推拿學、中醫醫史文獻3個學科為碩士學位授權點；中醫文獻學、方劑學、針灸學、中西醫結合臨床、中醫腎病學5個學科為國家級重點學科；中醫基礎理論、中西醫結合基儲針灸推拿學、中醫內科學4個學科為省重點扶持學科；中醫內科學、中醫基礎理論、金匱要