目前，中國已經形成了以職工醫保、居民醫保、新農合為主的覆蓋城鄉居民的基本醫療保險制度。
其中，職工醫保從1994年下半年啟動的兩江試點”，到1998年國務院頒布《關于建立城鎮職工基本醫療保險制度的決定》，運行時間超過15年;新農合從2003年至今走過了快速發展的10年;2007年啟動的居民醫保運行時間相對較短，但總體參保(參合)率已超過90%，相關政策制度也漸趨成熟。
整合醫保管理體制，已經具備了一定條件。從起初的制度設計來說，職工醫保和居民醫保由社保部門管理經辦，新農合由衛生部門管理經辦。運行至今，已經在管理經辦效率、醫療機構與醫保部門結算、人員重復參保等問題上顯示出弊端。特別是城鄉統籌、實現城鄉居民醫保受益公性的大環境，對醫保管理體制改革提出了新要求。”應亞珍對達內表示。
應亞珍解釋，現行的三種醫療保險制度中，居民醫保與新農合有很多相同之處，最具融合的基矗兩者的自愿參保(參合)、籌資標準、籌資主體等籌資政策基本一致，覆蓋人群的經濟能力、現有保障受益水也相差不大，兩者并軌管理幾乎不存在政策障礙。
采用‘分步走’的戰略，整合醫保管理體制，可能是現實和有效的途徑。而對重復參保問題而言，主要也在居民醫保與新農合人群之間，兩者并軌，就能解決這一問題。”應亞珍說。
目前已有不少地區，如浙江嘉興、寧波部分縣市、江蘇常熟、鎮江部分縣市、山西襄汾、安徽省合肥、蕪湖、阜陽的部分縣市都實現了居民醫保與新農合之間的并軌管理，基金互通。
應亞珍表示，城鎮職工在參保政策、籌資模式及籌資水等方面與其他兩個保險制度的差異較大，特別是籌資水相差5～7倍左右，保障受益的差距還客觀存在。所以，全國還鮮見把三種醫保制度完全并軌的實踐，即使有少數地區把三種制度整合在一個部門管理經辦，也沒有一個地方實現基金互通、補償政策統一。
綜合考量，在全國層面說，首先實現居民醫保與新農合的統籌管理，既具備現實條件，又能在一定程度上解決問題，也能真正實現這兩種保險制度覆蓋人群的城鄉統籌。”應亞珍表示。
據消息人士透露，目前職工保險以及經辦單位仍留在人保部。福建三明市剛完成此項改革，成立了獨立的醫療保障基金管理中心”，作為政府的直屬事業單位。與原相關部門協商制定各類醫保補償報銷政策，統一醫保定點機構，統一對醫療機構的管控指標，統一與醫療機構結算醫保資金，統一定點醫療機構藥品、耗材、設備采購等。
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